研究院科技服务中心主要依托南京理工大学技术转移中心、南京理工大学科技查新工作站，以及中国高校知识产权运营交易平台等科技服务资源开展科技服务工作。服务项目包括：企业科技咨询、项目申报辅导、知识产权服务、科技查新、高校技术转移服务等。

案例：（1）2018年江苏省重点研发计划重点项目由南京理工自动化研究院主持，中国矿业大学、南京金龙等8所全国知名大学和行业龙头企业共同参与，总投资2900万；

          （2）2018年南京理工自动化研究院建设列入“南京市经济社会发展重大项目”；

          （3）2018年主持南京市国际间（中国和澳大利亚）科技合作项目；

          （4）2020年主持南京市国际间（中国和斯洛文尼亚）科技合作项目。